尽管国家对沼气建设推广非常重视，并安排了大量的国债专项资金，但建设资金缺口仍然很大。

　　在现阶段，沼气工程仅仅依靠国家投资显然不现实。何平主任介绍说，目前在一些经济发达地区，沼气建设配套资金可以足额到位，而在一些欠发达地区，毕竟国家补助资金有限，不能全方位兼顾，完全靠农民自己是没有能力进行配套建设的。

　　何平建议说，农村沼气建设规模和投资力度不仅要考虑发展的需要和群众的需求，还要考虑建设能力、组织管理水平、建成后的管理与服务以及使用周期等综合因素。

　　“应把实施能力和后续管理与支持服务体系建设、配套资金落实到位等放在同等重要的地位，切忌不顾条件一哄而上”，何平说。

　　政府提出到“十一五”末期实现30%左右的适宜入户率，意味着仍有大多数农户无法实现沼气利用。

　　利用多种渠道筹集沼气项目建设资金，在现阶段很有必要。开展国际合作是一个可行的办法。2007年3月12日，农业部副部长危朝安在“新农村与可再生能源”国际研讨会上指出，由荷兰政府同农业部合作开展总投资达8400万元的“促进中国西部农村可再生能源综合发展应用”项目取得了成功试点。

　　该项目在西部地区选择了甘肃省天水市麦积区、四川省仪陇县等7个县(市)的16个村开展可再生能源和节能技术建设试点，大大改善了这些贫困地区农民的生产生活条件，促进了农民增产增收。以甘肃省天水市麦积区曹石村为例，与2002年相比，全村年节电1.2万千瓦时，节约薪柴500余吨、秸秆201吨。